Η πρωτεύουσα του νησιού, το Μεγαλοχώρι, δεν είναι παρά ένα χωριό σε μέγεθος, με πληθυσμό μικρότερο των 500.
Παράλληλα με τη Σκάλα είναι ο οικισμός που είναι περισσότερο προσανατολισμένος προς τον τουρισμό. Στην αρχαία Ελλάδα το λιμάνι του Μεγαλοχωρίου χρησιμοποιήθηκε ως ναυτική βάση, ενώ σήμερα είναι ένα απλό αλιευτικό λιμάνι με δίχτυα γεμισμένα στην αποβάθρα. Τα πλοία φθάνουν επίσης από την Αίγινα, καθώς και το "Flying Dophins" από τον Πειραιά. Αφήστε λίγο χρόνο για να περάσετε τα ασβεστωμένα σοκάκια του, φωτεινά με λουλούδια φούξια και να εντοπίσετε το ορόσημο του χωριού, έναν ανεμόμυλο που χρονολογείται από το 1812.
